企业申请中长期外债备案登记主要分为以下几个步骤。是准备备案材料，包括企业基本情况材料，如企业营业执照、组织机构代码证（若有）、税务登记证（若有）、公司章程以及企业内部决议文件等，用于证明企业的合法身份和内部决策程序。财务相关材料也必不可少，需提供企业近三年经审计的财务报告，包含资产负债表、利润表、现金流量表等，以评估企业的财务状况和偿债能力。融资计划材料要详细说明外债的用途、规模、期限、利率等，以及资金回流计划和还款计划。如果外债用于特定项目，还需提供项目可行性研究报告、项目审批、核准或备案文件等。还款能力证明材料，如银行出具的授信额度证明、担保函等，用以证明企业具备偿还外债的能力。根据具体情况，可能还需要提供境外合作方信息、环保批复（若涉及相关项目）、行业主管部门意见等其他辅助材料。
接着进行线上注册及申报。自 2020 年 11 月 1 日起，企业需进入国家发展改革委门户网站 “政务服务” 频道或指定的网络系统进行注册和登录。按照系统要求，完整、准确、如实地填报相关信息，并上传准备好的备案材料。
完成线上填报后，需提交申请。企业可以将纸质版材料报送至指定的政务服务大厅。建议在提交时附上网上申报的受理编号，并确保材料的真实性和完整性。如果企业不便现场提交，也可通过邮寄方式将纸质材料寄送至相关部门，但需注意邮寄的材料能够及时、安全地送达。
是审核与反馈阶段。政务服务大厅收到申请材料后，窗口工作人员会对申请材料进行形式审查，主要检查材料是否齐全、格式是否符合要求等。审查合格的予以接收。承办司局收到申请材料后，会对申请材料进行复审，审查合格的予以受理。审核登记机关自受理之日起，通常会在 3 个月内对申请进行审核，并出具审核结果。对于需要补充材料的，会及时通知企业进行补充。对于重大或复杂的外债项目，相关部门可能会进行实地现场核查，企业应积极配合。
若企业的备案申请获得批准，相关部门将出具备案证明，如《企业借用外债备案登记证明》。后是后续管理，企业在获得备案后，还需按照规定定期向相关部门报告外债资金使用情况、还款进度等，并及时处理可能出现的风险问题。